Los Gobiernos de Paraguay y del Brasil tienen la atribución de designar a los miembros del Directorio Ejecutivo de la Itaipu Binacional, por medio de la Administración Nacional de Electricidad (ANDE) o de la ENBPar. Para cada cargo reservado a un país, hay un puesto equivalente destinado a la otra margen.

El Consejo Directivo está integrado por doce asesores, seis brasileños y seis paraguayos, y dos representantes de los Ministerios de Relaciones Exteriores, uno de cada país. La Junta Directiva se reúne cada dos meses o en convocatoria extraordinaria.

El Directorio Ejecutivo y el Consejo de Administración tienen facultades y deberes establecidos en el Anexo A del Tratado de Itaipú y en el Reglamento Interno.